Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms