Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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