Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KLF12Q9Y4X4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms