Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GIT1Q9Y2X7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms