Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC17A7Q9P2U7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms