Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG3Q9NT62 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms