Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GKN1Q9NS71 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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