Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TIMMDC1Q9NPL8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TIMMDC1Q9NPL8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TIMMDC1Q9NPL8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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