Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms