Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOJQ9H4E5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms