Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
KRTAP2-1Q9BYU5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms