Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC2Q9BYS8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRRC2Q9BYS8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms