Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNPPD1Q9BV87 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms