Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms