Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP88Q99567 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms