Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms