Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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USP47Q96K76 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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