Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCEAL3Q969E4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCEAL3Q969E4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms