Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATL1Q8WXF7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms