Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC12Q8WUD4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC12Q8WUD4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms