Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms