Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms