Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms