Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms