Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OTOAQ7RTW8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms