Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms