Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPOCD1Q6ZMY3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms