Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRIG3Q6UXM1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms