Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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