Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM46CQ5VWP2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms