Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms