Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PXDC1Q5TGL8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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