Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q499Y3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q499Y3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q499Y3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q499Y3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q499Y3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q499Y3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q499Y3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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