Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TTLL9Q3SXZ7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms