Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RRN3P1Q2M238 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RRN3P1Q2M238 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RRN3P1Q2M238 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RRN3P1Q2M238 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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