Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DDR2Q16832 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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