Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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