Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SGCAQ16586 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCAQ16586 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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