Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDCD2Q16342 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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