Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNGA3Q16281 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNGA3Q16281 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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