Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC6Q16204 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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