Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CST6Q15828 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CST6Q15828 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CST6Q15828 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CST6Q15828 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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