Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCEA2Q15560 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms