Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RAB39AQ14964 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms