Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms