Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CAPSQ13938 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.7 ms