Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms