Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms