Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms