Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRQ13535 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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